1.心血管疾病：
若早产儿肺部问题逐渐好转时，会因动脉导管尚未关闭，而有多的血量自主动脉经由动脉导管流至肺，造成心脏衰竭及肺功能变差。
2.呼吸系统疾病：
因早产儿的肺部发育不全，因此会造成呼吸困难，甚至呼吸衰竭。部分体重极低的宝宝也会有呼吸窘迫症候群，而有呼吸急促、发绀的现象。
3.肠胃系统疾病：
早产儿容易有营养吸收不良的毛病，因此最好喂以母奶；即使不得已要以配方奶替代，也最好采取少量渐近式的喂食方式。此外，有极少部份的早产儿会发生坏死性肠炎，需要特殊的治疗。
4.周脑室及脑室内出血：
因早产儿脑室构造不成熟，血管构造相当脆弱，很容易易因脑压升高，而破裂出血。一般可分为四级，若是轻微出血，且未造成脑室扩大，多半会由脑自行吸收。但是若因大量出血，造成脑室扩大或扩及脑组织，就有可能影响神经功能，造成动作发展迟缓或行为障碍。应于出生后，作脑部超音波，若有问题则需定期追踪检查。
5.视网膜病变：
早产可能导致视网膜新生血管的正常发育受阻，而造成眼部发育不良，较易有近视等问题，应至儿童眼科追踪检查。
6.感染问题：
早产儿因免疫系统尚未发育完全，较没有对抗病毒的能力，非常容易受感染，而且一旦感染很容易造成败血症，甚至于脑膜炎，需要特别注意。
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